Κύριος σκοπός του Ιδρύµατος είναι η συστηµατική ανάδειξη της ιστορικής και πολιτιστικής παρουσίας της Μεσσηνιακής Καστροπολιτείας στη διαχρονική πορεία του Ελληνισµού και ο εντοπισμός, η ανάδειξη και η διεθνοποίηση των συγκριτικών πλεονεκτημάτων περιοχών της Ελληνικής περιφέρειας μέσα από τρεις πυλώνες δράσεων: πολιτιστικές, αναπτυξιακές και κοινωνικές.
Ο Δήμος Πύλου-Νέστορος είναι ένα προνομιακό παρατηρητήριο για τις διαμεσογειακές πολιτιστικές και εμπορικές συναλλαγές μεταξύ της λατινικής δύσης και της ελληνικής ανατολής. Τα λιμάνια της Κορώνης, της Μεθώνης και της Πύλου με την εύφορη ενδοχώρα και τα γύρω νησιά, προσδιόριζαν το χώρο της νότιας Μεσσηνίας ως στρατηγικό κόμβο για τις ακτοπλοϊκές γραμμές μεταξύ Ιονίου και Αιγαίου, για το σύνολο της περιόδου της ναυσιπλοΐας.
Μέσα από την μακραίωνη επικοινωνία τους με τη θάλασσα, τα ερείπια των καστροπολιτειών της Μεθώνης, της Κορώνης και της Πύλου είναι σίγουρα οι πιο σημαντικές ιστορικές μαρτυρίες και αποτελούν τη μεγαλύτερη πρόκληση για το μέλλον, που δεν είναι άλλη από την επανατοποθέτησή τους στον πολιτιστικό, οικονομικό και κοινωνικό ιστό της περιοχής.